وللشيخ عيسى قاسم العديد من المواقف الوطنية سواء قبل انطلاق ثورة 14 فبراير او بعدها من خلال خطاباته وبياناته ومواقفه العملية. لكن هناك موقفين ادلى بهما الشيخ في خطاباته سابقة جعلت منه نارا على علم منها حين دعا الى سحق كل من يتعرض الى حرائر البحرين المشاركات في مسيرات الاحتجاج ضد السلطات . والثانية حين صدح صوته بعدم الركوع الا لله. ذلك الشعار الذي بات فيما بعد يتصدر جميع المسيرات ولحد الان.
109-1