وأكدت هيئة الطيران السوداني أن سلطات الطيران السعودية كانت على علم بأن الطائرة رئاسية، لكنها أصرت على منع عبورها الاجواء السعودية رغم وجود طلب اذن مسبق.
وكانت الرياض ادعت أن الخرطوم لم تبلغها بوجود الرئيس البشير على متن الطائرة وأنها لم تأخذ إذنا مسبقا بالعبور.