وفي لقاء متلفز قال شفيق إنه سوف يضيف بعض السطور من الانجيل، مثله مثل الآيات القرانية، في المناهج الدراسية او يحذف كلاهما من المناهج.
وأثارت هذه التصريحات حفيظة عدد من الدعاة والمشايخ في مصر.
وفي تعقيبه على تصريحاته المثيرة للجدل، قال الشيخ يوسف البدري، الداعية الاسلامي، إن كلام شفيق حول أنه ينوي أن يحذف آيات القرآن من المناهج الدراسية أو أن يضيف بجانبها كلمات من الإنجيل تعتبر عزفًا على وتر الأقباط حتى ينتخبوه.
وتابع قائلا: "شفيق قد باع دينه بعرض رخيص من الدنيا" وهذا لا يصح لأن دين الدولة التي تدين به هو الإسلام ونسبة 95% من المواطنين مسلمين وهو كلام باطل.
ودعا البدري، الأقباط لعدم انتخاب شفيق قائلاً : لا تنتخبوا هذا الرجل فلو نجح شفيق فسوف يضيع الوطن وتضيع معه دماء الشهداء وتضيع الأديان.